Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHBDD3Q9Y3P4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms