Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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