Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD3Q9UJU5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms