Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFMBT1Q9UHJ3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms