Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NPC1L1Q9UHC9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPC1L1Q9UHC9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms