Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ARFGAP3Q9NP61 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ARFGAP3Q9NP61 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ARFGAP3Q9NP61 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ARFGAP3Q9NP61 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ARFGAP3Q9NP61 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ARFGAP3Q9NP61 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ARFGAP3Q9NP61 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ARFGAP3Q9NP61 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms