Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
REEP4Q9H6H4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms