Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF17Q9BXT8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms