Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms