Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNPPD1Q9BV87 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms