Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 ATG10-IT1-201ENST00000396880 487 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AIRN-202ENST00000609176 1489 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHF12Q96QT6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms