Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SORCS2Q96PQ0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms