Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZBED3Q96IU2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZBED3Q96IU2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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