Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIRT1Q96EB6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms