Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OTUB2Q96DC9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms