Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms