Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBXN4Q92575 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBXN4Q92575 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms