Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD1Q8NBU5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms