Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC50Q8IVM0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC50Q8IVM0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms