Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2Q1Q7Z7E8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms