Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms