Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDC4Q6P2E9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDC4Q6P2E9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms