Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1QL3Q5VWW1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C1QL3Q5VWW1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms