Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms