Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PIK3CD-AS1Q5SR53 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms