Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC27A3Q5K4L6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms