Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ODF2Q5BJF6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ODF2Q5BJF6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms