Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RFTN2Q52LD8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms