Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
CDNFQ49AH0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDNFQ49AH0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms