Protein–RNA interactions for Protein: Q17RN3

FAM98C, Protein FAM98C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM98CQ17RN3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM98CQ17RN3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM98CQ17RN3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms