Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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EXT1Q16394 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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EXT1Q16394 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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EXT1Q16394 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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EXT1Q16394 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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EXT1Q16394 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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EXT1Q16394 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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EXT1Q16394 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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EXT1Q16394 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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EXT1Q16394 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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EXT1Q16394 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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