Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATP6AP1Q15904 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6AP1Q15904 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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