Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
USF2Q15853 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
USF2Q15853 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
USF2Q15853 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
USF2Q15853 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
USF2Q15853 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
USF2Q15853 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
USF2Q15853 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
USF2Q15853 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
USF2Q15853 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
USF2Q15853 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
USF2Q15853 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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