Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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