Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1CQ13936 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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