Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTGDRQ13258 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms