Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXM1Q08050 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXM1Q08050 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms