Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL16A1Q07092 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COL16A1Q07092 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms