Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAD51Q06609 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAD51Q06609 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms