Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC18A2Q05940 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms