Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CHRNB3Q05901 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms