Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKCDQ05655 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms