Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TOP2BQ02880 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP2BQ02880 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms