Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDK16Q00536 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms