Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNB1P98172 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB1P98172 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms