Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP46P62068 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP46P62068 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP46P62068 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP46P62068 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP46P62068 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP46P62068 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP46P62068 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP46P62068 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP46P62068 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP46P62068 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP46P62068 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP46P62068 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP46P62068 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP46P62068 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP46P62068 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP46P62068 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP46P62068 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP46P62068 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP46P62068 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP46P62068 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP46P62068 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP46P62068 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP46P62068 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP46P62068 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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