Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUCLG1P53597 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms