Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC6A9P48067 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms