Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CDKN1BP46527 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CDKN1BP46527 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CDKN1BP46527 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDKN1BP46527 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDKN1BP46527 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDKN1BP46527 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDKN1BP46527 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDKN1BP46527 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDKN1BP46527 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDKN1BP46527 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDKN1BP46527 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDKN1BP46527 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDKN1BP46527 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDKN1BP46527 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDKN1BP46527 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDKN1BP46527 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDKN1BP46527 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDKN1BP46527 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDKN1BP46527 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDKN1BP46527 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDKN1BP46527 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CDKN1BP46527 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms