Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRATP43155 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRATP43155 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRATP43155 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms